Возникновение негемадсорбирующих вариантов вируса АЧС генотипа II и эволюционные изменения вакцинного штамма во Вьетнаме
Африканская чума свиней (АЧС) — разрушительное трансграничное заболевание, вызывающее тяжелые социально-экономические потери в мировом свиноводстве. За пределами Африки циркулируют генотипы I и II вируса АЧС. После заноса генотипа II в Грузию в 2007 году вирус распространился по Европе и Азии, достигнув Вьетнама в 2019 году. В последние годы наблюдается растущая генетическая гетерогенность вируса: совместная циркуляция генотипов I и II в Китае привела к появлению высоковирулентных рекомбинантных вариантов, обнаруженных во Вьетнаме в 2023 году. Во Вьетнаме также лицензированы и используются живые аттенуированные вакцины (ASFV-G-ΔI177L и ASFV-G-ΔMGF), что может создавать дополнительные эволюционные давления.
Отличительной особенностью большинства высоковирулентных штаммов генотипа II является гемадсорбирующий (HAD+) фенотип, опосредованный геном EP402R. Однако в последнее время в Европе и Азии зарегистрированы природные HAD-отрицательные изоляты. Для решения проблемы недостаточной изученности их геномного разнообразия проведено полногеномное секвенирование трех HAD-отрицательных изолятов генотипа II, выделенных от свиней с затяжными клиническими проявлениями в северном Вьетнаме.
У всех трех изолятов выявлены нонсенс-мутации в гене EP402R (G57A в изолятах 2024 года и G132A в изоляте 2023 года), приводящие к преждевременным стоп-кодонам. Мутация G57A, ранее обнаруженная в центральном и южном Вьетнаме, выявлена на севере, что свидетельствует о ее географической экспансии. Обнаружение различных независимых мутаций, нарушающих функцию EP402R, указывает на возможный повторяющийся эволюционный путь потери гемадсорбции. Помимо EP402R, выявлены значительные изменения в регионах множественных генетических семейств (MGF), известных своей ролью в модуляции врожденного иммунитета и вирулентности.
Наиболее важным результатом явилась идентификация одного из изолятов (VNUA/ASFV/VP2023-isolate1), который филогенетически кластеризовался с вакцинным штаммом ASFV-G-ΔI177L (лицензирован во Вьетнаме) и содержал делецию гена I177L с вставкой маркера mCherry, что убедительно свидетельствует о его вакцинном происхождении с последующими дополнительными геномными изменениями в процессе полевой циркуляции.
Полученные данные подчеркивают важность непрерывного геномного надзора и поствакцинального мониторинга при применении живых аттенуированных вакцин в эндемичных условиях. Обнаружение эволюции вакцинопроизводного штамма ставит вопросы о биобезопасности, мониторинге вакцин и регуляторном надзоре. Результаты демонстрируют динамический характер эволюции вируса АЧС и острую необходимость функциональной характеристики новых вариантов для обеспечения эффективных и безопасных стратегий контроля заболевания.
