Геномный анализ и характеристика патогенных свойств нового штамма вируса РРСС-1 HBEU-328, выявленного в Северном Китае
Вирус репродуктивно-респираторного синдрома свиней (РРСС) представляет собой значимую угрозу для глобального свиноводства. Китай, являясь крупнейшим в мире производителем и потребителем свинины, сталкивается с наиболее выраженными экономическими последствиями, ассоциированными с данной инфекцией. Несмотря на длительное доминирование вируса РРСС 2-го типа (РРСС-2) в структуре заболеваемости в Китае, в последние годы возрастает эпидемиологическое значение вируса РРСС 1-го типа (РРСС-1), в частности его генетической подгруппы BJEU06-1. Учитывая, что уровень гомологии геномов различных подтипов РРСС не превышает 60%, существующие вакцинные препараты не обеспечивают достаточной кросс-защиты против потенциально циркулирующих в Китае штаммов РРСС-1. В связи с этим мониторинг распространенности РРСС-1 приобретает критическое значение для контроля эпизоотической ситуации.
В настоящее время эпизоотический ландшафт РРСС в Китае по-прежнему определяется преимущественно штаммами РРСС-2. Вместе с тем, интенсификация международных контактов в сфере свиноводства способствовала учащению заносов и распространению РРСС-1, который в настоящее время выявлен более чем в 24 провинциях и регионах Китая. Филогенетический анализ эндемичных изолятов позволяет классифицировать РРСС-1 на семь генетических подгрупп, что свидетельствует о растущем генетическом разнообразии вируса и его потенциальной угрозе для национального свиноводства.
Штаммы РРСС-1 характеризуются более выраженной иммуносупрессивной активностью и способностью к персистенции по сравнению с РРСС-2, а также тропизмом к широкому спектру тканей, что осложняет их контроль. Данные мониторинга свидетельствуют о более высокой скорости мутационного процесса у РРСС-1: частота замен составляет приблизительно 1,01 × 10⁻² на сайт в год, что превышает аналогичный показатель для РРСС-2 (9,6 × 10⁻³). Указанные особенности предполагают более высокий эволюционный потенциал РРСС-1 и усложняют прогнозирование его эпидемической динамики.
Большинство имеющихся работ, посвященных штаммам РРСС-1 подгруппы BJEU06-1, сосредоточено на их молекулярной характеристике, тогда как данные о патогенности данных изолятов для интактных поросят, особенно в регионе Северного Китая, остаются ограниченными. В августе 2022 года на крупной свиноводческой ферме (без применения вакцинации против РРСС) в провинции Хэбэй была зарегистрирована вспышка заболевания, проявлявшаяся диареей, хромотой и респираторными симптомами. В ходе исследования из патологического материала был выделен штамм РРСС-1, обозначенный как HBEU-328. Проведены полногеномное секвенирование, филогенетический анализ и оценка патогенности изолята с целью уточнения его таксономического положения, молекулярных характеристик и эпизоотического потенциала.
Установлено, что штамм HBEU-328 относится к подгруппе BJEU06-1 и демонстрирует тесное филогенетическое родство с изолятом TZJ637, выделенным в провинции Хэнань, что указывает на существование межрегиональных путей передачи вируса между Северным Китаем и Центральной равниной. По результатам патогенетических испытаний штамм HBEU-328 классифицирован как обладающий умеренной вирулентностью для поросят.
Проведенное исследование расширяет существующие данные о распространении и генетическом разнообразии штаммов РРСС-1 подгруппы BJEU06-1 в Северном Китае, уточняет закономерности эволюции и межрегиональной передачи вируса, а также создает научную основу для совершенствования систем мониторинга, разработки целевых мер профилактики и контроля РРСС-1 на территории Китая.
